Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ube2e3P52483 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ube2e3P52483 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ube2e3P52483 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ube2e3P52483 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2e3P52483 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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