Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClgnP52194 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ClgnP52194 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClgnP52194 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClgnP52194 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClgnP52194 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ClgnP52194 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClgnP52194 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClgnP52194 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms