Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccr5P51682 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccr5P51682 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccr5P51682 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr5P51682 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr5P51682 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr5P51682 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr5P51682 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr5P51682 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr5P51682 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr5P51682 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr5P51682 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr5P51682 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr5P51682 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr5P51682 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr5P51682 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr5P51682 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr5P51682 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr5P51682 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr5P51682 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr5P51682 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr5P51682 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr5P51682 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr5P51682 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr5P51682 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr5P51682 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr5P51682 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr5P51682 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr5P51682 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr5P51682 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms