Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Opn1swP51491 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Opn1swP51491 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Opn1swP51491 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Opn1swP51491 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Opn1swP51491 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Opn1swP51491 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Opn1swP51491 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Opn1swP51491 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Opn1swP51491 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms