Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RoraP51448 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RoraP51448 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RoraP51448 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RoraP51448 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RoraP51448 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RoraP51448 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RoraP51448 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RoraP51448 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RoraP51448 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RoraP51448 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RoraP51448 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RoraP51448 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RoraP51448 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RoraP51448 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RoraP51448 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RoraP51448 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RoraP51448 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RoraP51448 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RoraP51448 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RoraP51448 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RoraP51448 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RoraP51448 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RoraP51448 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RoraP51448 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RoraP51448 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RoraP51448 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RoraP51448 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RoraP51448 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RoraP51448 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RoraP51448 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RoraP51448 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RoraP51448 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RoraP51448 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RoraP51448 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RoraP51448 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RoraP51448 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RoraP51448 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RoraP51448 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RoraP51448 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RoraP51448 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RoraP51448 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RoraP51448 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RoraP51448 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RoraP51448 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RoraP51448 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RoraP51448 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RoraP51448 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RoraP51448 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RoraP51448 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RoraP51448 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RoraP51448 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RoraP51448 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RoraP51448 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RoraP51448 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RoraP51448 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RoraP51448 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RoraP51448 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RoraP51448 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RoraP51448 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RoraP51448 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RoraP51448 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RoraP51448 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RoraP51448 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RoraP51448 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RoraP51448 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RoraP51448 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RoraP51448 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RoraP51448 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RoraP51448 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RoraP51448 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RoraP51448 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RoraP51448 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RoraP51448 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RoraP51448 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RoraP51448 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RoraP51448 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RoraP51448 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RoraP51448 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RoraP51448 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RoraP51448 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RoraP51448 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RoraP51448 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RoraP51448 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RoraP51448 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RoraP51448 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RoraP51448 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RoraP51448 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RoraP51448 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RoraP51448 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RoraP51448 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RoraP51448 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RoraP51448 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RoraP51448 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RoraP51448 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RoraP51448 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RoraP51448 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RoraP51448 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RoraP51448 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RoraP51448 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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