Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa6P50704 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa6P50704 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms