Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx3P50481 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms