Protein–RNA interactions for Protein: P50428

Arsa, Arylsulfatase A, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArsaP50428 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ArsaP50428 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ArsaP50428 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ArsaP50428 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ArsaP50428 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ArsaP50428 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ArsaP50428 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ArsaP50428 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ArsaP50428 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ArsaP50428 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ArsaP50428 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ArsaP50428 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ArsaP50428 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ArsaP50428 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ArsaP50428 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ArsaP50428 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ArsaP50428 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ArsaP50428 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ArsaP50428 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ArsaP50428 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ArsaP50428 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ArsaP50428 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ArsaP50428 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ArsaP50428 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ArsaP50428 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ArsaP50428 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ArsaP50428 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ArsaP50428 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
ArsaP50428 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
ArsaP50428 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
ArsaP50428 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ArsaP50428 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ArsaP50428 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ArsaP50428 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ArsaP50428 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ArsaP50428 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ArsaP50428 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ArsaP50428 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ArsaP50428 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ArsaP50428 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ArsaP50428 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ArsaP50428 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ArsaP50428 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ArsaP50428 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ArsaP50428 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ArsaP50428 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ArsaP50428 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ArsaP50428 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ArsaP50428 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ArsaP50428 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ArsaP50428 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ArsaP50428 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ArsaP50428 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ArsaP50428 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ArsaP50428 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ArsaP50428 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ArsaP50428 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ArsaP50428 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ArsaP50428 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ArsaP50428 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ArsaP50428 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ArsaP50428 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ArsaP50428 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ArsaP50428 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ArsaP50428 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ArsaP50428 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ArsaP50428 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ArsaP50428 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ArsaP50428 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ArsaP50428 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ArsaP50428 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ArsaP50428 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ArsaP50428 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ArsaP50428 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ArsaP50428 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ArsaP50428 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ArsaP50428 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ArsaP50428 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ArsaP50428 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ArsaP50428 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ArsaP50428 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
ArsaP50428 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ArsaP50428 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ArsaP50428 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ArsaP50428 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ArsaP50428 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ArsaP50428 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ArsaP50428 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ArsaP50428 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ArsaP50428 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ArsaP50428 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ArsaP50428 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
ArsaP50428 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ArsaP50428 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ArsaP50428 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ArsaP50428 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ArsaP50428 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ArsaP50428 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ArsaP50428 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ArsaP50428 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms