Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SftpbP50405 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpbP50405 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpbP50405 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpbP50405 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpbP50405 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpbP50405 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpbP50405 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpbP50405 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpbP50405 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SftpbP50405 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SftpbP50405 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpbP50405 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpbP50405 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms