Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms