Protein–RNA interactions for Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp9P49962 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp9P49962 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp9P49962 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp9P49962 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp9P49962 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp9P49962 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp9P49962 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp9P49962 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp9P49962 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Srp9P49962 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Srp9P49962 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Srp9P49962 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Srp9P49962 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Srp9P49962 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp9P49962 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp9P49962 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp9P49962 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp9P49962 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp9P49962 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Srp9P49962 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms