Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CitP49025 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CitP49025 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CitP49025 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CitP49025 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CitP49025 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CitP49025 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CitP49025 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CitP49025 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CitP49025 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CitP49025 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CitP49025 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CitP49025 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CitP49025 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CitP49025 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CitP49025 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CitP49025 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CitP49025 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CitP49025 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CitP49025 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CitP49025 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CitP49025 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CitP49025 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CitP49025 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CitP49025 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CitP49025 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CitP49025 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CitP49025 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CitP49025 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CitP49025 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CitP49025 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CitP49025 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CitP49025 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CitP49025 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CitP49025 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CitP49025 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CitP49025 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CitP49025 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CitP49025 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CitP49025 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CitP49025 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CitP49025 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CitP49025 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CitP49025 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CitP49025 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CitP49025 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CitP49025 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CitP49025 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CitP49025 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CitP49025 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CitP49025 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CitP49025 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CitP49025 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CitP49025 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CitP49025 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CitP49025 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CitP49025 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CitP49025 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CitP49025 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CitP49025 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CitP49025 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CitP49025 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CitP49025 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CitP49025 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CitP49025 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CitP49025 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CitP49025 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CitP49025 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CitP49025 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CitP49025 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CitP49025 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CitP49025 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CitP49025 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CitP49025 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CitP49025 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CitP49025 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CitP49025 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CitP49025 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CitP49025 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CitP49025 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CitP49025 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CitP49025 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CitP49025 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CitP49025 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CitP49025 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CitP49025 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CitP49025 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CitP49025 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CitP49025 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CitP49025 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CitP49025 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CitP49025 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CitP49025 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CitP49025 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CitP49025 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CitP49025 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CitP49025 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CitP49025 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CitP49025 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CitP49025 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms