Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnni3P48787 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms