Protein–RNA interactions for Protein: P48725

Pcnt, Pericentrin, mousemouse

Predictions only

Length 2,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcntP48725 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcntP48725 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcntP48725 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcntP48725 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcntP48725 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcntP48725 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcntP48725 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcntP48725 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcntP48725 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PcntP48725 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PcntP48725 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PcntP48725 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PcntP48725 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PcntP48725 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcntP48725 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcntP48725 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcntP48725 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PcntP48725 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PcntP48725 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcntP48725 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PcntP48725 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcntP48725 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcntP48725 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcntP48725 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcntP48725 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PcntP48725 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PcntP48725 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcntP48725 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcntP48725 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcntP48725 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcntP48725 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PcntP48725 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcntP48725 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PcntP48725 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcntP48725 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcntP48725 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcntP48725 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcntP48725 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcntP48725 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcntP48725 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcntP48725 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcntP48725 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcntP48725 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcntP48725 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcntP48725 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcntP48725 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcntP48725 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcntP48725 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcntP48725 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PcntP48725 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcntP48725 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcntP48725 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PcntP48725 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcntP48725 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcntP48725 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcntP48725 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PcntP48725 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcntP48725 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcntP48725 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PcntP48725 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PcntP48725 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcntP48725 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcntP48725 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcntP48725 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcntP48725 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcntP48725 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcntP48725 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcntP48725 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcntP48725 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcntP48725 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcntP48725 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcntP48725 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcntP48725 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcntP48725 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PcntP48725 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcntP48725 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcntP48725 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcntP48725 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcntP48725 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcntP48725 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcntP48725 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcntP48725 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcntP48725 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcntP48725 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcntP48725 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcntP48725 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcntP48725 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcntP48725 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcntP48725 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcntP48725 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcntP48725 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcntP48725 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcntP48725 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcntP48725 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcntP48725 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcntP48725 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcntP48725 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcntP48725 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcntP48725 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcntP48725 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms