Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LmnaP48678 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LmnaP48678 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LmnaP48678 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LmnaP48678 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LmnaP48678 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LmnaP48678 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LmnaP48678 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LmnaP48678 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LmnaP48678 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LmnaP48678 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LmnaP48678 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LmnaP48678 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms