Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms