Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gli1P47806 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gli1P47806 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gli1P47806 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gli1P47806 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gli1P47806 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gli1P47806 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gli1P47806 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gli1P47806 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gli1P47806 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gli1P47806 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gli1P47806 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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