Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrprbP47758 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrprbP47758 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SrprbP47758 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrprbP47758 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SrprbP47758 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrprbP47758 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SrprbP47758 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SrprbP47758 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms