Protein–RNA interactions for Protein: P46978

Stt3a, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3A, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stt3aP46978 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stt3aP46978 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stt3aP46978 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stt3aP46978 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stt3aP46978 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stt3aP46978 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms