Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdkn1bP46414 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cdkn1bP46414 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms