Protein–RNA interactions for Protein: P43687

Hmx2, Homeobox protein HMX2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx2P43687 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmx2P43687 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms