Protein–RNA interactions for Protein: P43247

Msh2, DNA mismatch repair protein Msh2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh2P43247 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msh2P43247 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msh2P43247 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msh2P43247 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh2P43247 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh2P43247 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh2P43247 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh2P43247 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh2P43247 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh2P43247 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msh2P43247 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms