Protein–RNA interactions for Protein: P43006

Slc1a2, Excitatory amino acid transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a2P43006 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a2P43006 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms