Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rpl28P41105 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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