Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PpargP37238 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PpargP37238 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PpargP37238 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PpargP37238 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PpargP37238 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PpargP37238 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PpargP37238 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PpargP37238 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PpargP37238 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PpargP37238 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PpargP37238 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PpargP37238 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PpargP37238 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PpargP37238 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PpargP37238 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PpargP37238 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PpargP37238 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PpargP37238 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PpargP37238 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PpargP37238 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PpargP37238 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PpargP37238 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PpargP37238 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PpargP37238 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PpargP37238 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PpargP37238 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PpargP37238 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PpargP37238 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PpargP37238 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PpargP37238 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PpargP37238 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PpargP37238 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PpargP37238 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PpargP37238 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PpargP37238 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PpargP37238 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PpargP37238 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PpargP37238 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PpargP37238 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PpargP37238 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PpargP37238 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PpargP37238 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PpargP37238 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PpargP37238 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PpargP37238 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PpargP37238 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PpargP37238 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PpargP37238 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PpargP37238 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PpargP37238 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PpargP37238 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PpargP37238 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PpargP37238 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PpargP37238 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PpargP37238 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PpargP37238 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PpargP37238 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PpargP37238 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PpargP37238 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PpargP37238 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PpargP37238 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PpargP37238 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PpargP37238 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PpargP37238 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PpargP37238 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PpargP37238 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PpargP37238 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PpargP37238 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PpargP37238 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PpargP37238 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PpargP37238 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PpargP37238 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PpargP37238 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PpargP37238 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PpargP37238 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PpargP37238 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PpargP37238 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PpargP37238 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PpargP37238 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PpargP37238 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PpargP37238 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PpargP37238 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PpargP37238 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PpargP37238 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PpargP37238 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PpargP37238 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PpargP37238 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PpargP37238 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PpargP37238 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PpargP37238 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PpargP37238 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PpargP37238 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PpargP37238 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PpargP37238 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PpargP37238 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PpargP37238 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PpargP37238 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PpargP37238 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PpargP37238 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms