Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprkP35822 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtprkP35822 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PtprkP35822 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprkP35822 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprkP35822 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprkP35822 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms