Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn1P35821 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms