Protein–RNA interactions for Protein: P35546

Ret, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase receptor Ret, mousemouse

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Length 1,115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetP35546 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RetP35546 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RetP35546 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RetP35546 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RetP35546 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RetP35546 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RetP35546 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RetP35546 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RetP35546 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RetP35546 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RetP35546 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RetP35546 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RetP35546 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RetP35546 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RetP35546 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RetP35546 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RetP35546 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RetP35546 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RetP35546 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RetP35546 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RetP35546 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RetP35546 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RetP35546 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RetP35546 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RetP35546 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RetP35546 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RetP35546 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RetP35546 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RetP35546 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RetP35546 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RetP35546 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RetP35546 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RetP35546 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RetP35546 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RetP35546 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RetP35546 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RetP35546 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RetP35546 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RetP35546 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RetP35546 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RetP35546 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RetP35546 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RetP35546 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RetP35546 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RetP35546 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RetP35546 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RetP35546 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RetP35546 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RetP35546 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RetP35546 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RetP35546 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RetP35546 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RetP35546 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RetP35546 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RetP35546 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RetP35546 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RetP35546 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RetP35546 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RetP35546 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RetP35546 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RetP35546 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RetP35546 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RetP35546 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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RetP35546 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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RetP35546 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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RetP35546 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RetP35546 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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RetP35546 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RetP35546 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RetP35546 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RetP35546 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RetP35546 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RetP35546 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RetP35546 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RetP35546 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RetP35546 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RetP35546 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RetP35546 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RetP35546 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RetP35546 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RetP35546 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RetP35546 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RetP35546 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RetP35546 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RetP35546 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RetP35546 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RetP35546 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RetP35546 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RetP35546 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RetP35546 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RetP35546 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RetP35546 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RetP35546 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RetP35546 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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