Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ly6dP35459 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms