Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab20P35295 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab20P35295 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab20P35295 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab20P35295 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab20P35295 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab20P35295 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab20P35295 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab20P35295 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms