Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn11P35235 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms