Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apoc1P34928 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apoc1P34928 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms