Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ptk2P34152 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms