Protein–RNA interactions for Protein: P33610

Prim2, DNA primase large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim2P33610 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim2P33610 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim2P33610 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim2P33610 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim2P33610 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim2P33610 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim2P33610 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim2P33610 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prim2P33610 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prim2P33610 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms