Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms