Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cd28P31041 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cd28P31041 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Cd28P31041 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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