Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ctnnd1P30999 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnnd1P30999 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms