Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccnd3P30282 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccnd3P30282 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccnd3P30282 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccnd3P30282 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccnd3P30282 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccnd3P30282 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccnd3P30282 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccnd3P30282 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccnd3P30282 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccnd3P30282 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccnd3P30282 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccnd3P30282 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccnd3P30282 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccnd3P30282 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccnd3P30282 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccnd3P30282 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccnd3P30282 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccnd3P30282 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccnd3P30282 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccnd3P30282 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccnd3P30282 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccnd3P30282 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccnd3P30282 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccnd3P30282 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccnd3P30282 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccnd3P30282 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccnd3P30282 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccnd3P30282 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccnd3P30282 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccnd3P30282 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccnd3P30282 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms