Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msr1P30204 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msr1P30204 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msr1P30204 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msr1P30204 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msr1P30204 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms