Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Pabpc1P29341 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pabpc1P29341 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms