Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprmP28828 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprmP28828 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprmP28828 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprmP28828 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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PtprmP28828 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PtprmP28828 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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PtprmP28828 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprmP28828 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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PtprmP28828 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprmP28828 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprmP28828 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprmP28828 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprmP28828 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
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