Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kif5cP28738 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kif5cP28738 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kif5cP28738 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kif5cP28738 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kif5cP28738 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kif5cP28738 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kif5cP28738 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kif5cP28738 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kif5cP28738 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kif5cP28738 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kif5cP28738 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kif5cP28738 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kif5cP28738 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kif5cP28738 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kif5cP28738 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kif5cP28738 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kif5cP28738 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kif5cP28738 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Kif5cP28738 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kif5cP28738 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Kif5cP28738 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Kif5cP28738 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Kif5cP28738 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kif5cP28738 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif5cP28738 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms