Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms