Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChgaP26339 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChgaP26339 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ChgaP26339 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ChgaP26339 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ChgaP26339 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ChgaP26339 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ChgaP26339 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms