Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms