Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd12P23812 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd12P23812 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd12P23812 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd12P23812 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd12P23812 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd12P23812 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd12P23812 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd12P23812 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd12P23812 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd12P23812 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd12P23812 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd12P23812 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd12P23812 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd12P23812 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd12P23812 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd12P23812 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd12P23812 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd12P23812 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd12P23812 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd12P23812 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd12P23812 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd12P23812 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms