Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkchP23298 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkchP23298 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkchP23298 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkchP23298 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkchP23298 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkchP23298 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkchP23298 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkchP23298 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkchP23298 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms