Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja1P23242 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja1P23242 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja1P23242 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja1P23242 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja1P23242 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja1P23242 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja1P23242 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja1P23242 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja1P23242 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja1P23242 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja1P23242 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gja1P23242 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gja1P23242 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja1P23242 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms