Protein–RNA interactions for Protein: P22907

Hmbs, Porphobilinogen deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmbsP22907 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmbsP22907 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmbsP22907 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HmbsP22907 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmbsP22907 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HmbsP22907 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 238.3 ms