Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ms4a2P20490 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms